Opera\defaultsにあるstandard_menu.iniを開くと [Browser File Menu] Platform Mac, Item, 50977 = Save document with images as となってるんで、Platform Mac,を削って Item, 50977 = Save document with images as として、Opera再起動すると、"ファイル"→"画像を含め完全に保存"が復活します。
また「キーボード設定の編集」で Application項にある「s ctrl」を 「Save document」→「Save document with images as」 に変えることでキーボードでも画像付きHTMLファイルを保存できるようになります。